На основном уровне музея находится главный экспонат – «Кирения-Элефтерия» (Кириния)– точная копия древнегреческого судна, затонувшего в конце 4 века до н. э. у берегов Северного Кипра.
В 1965 г. Андреас Карьелу, моряк и ловец морских губок, обнаружил на дне моря остов корабля и 80 амфор. Карьелу удалось с помощью простенького фотографического аппарата сделать снимки своей находки, а после он поднял со дна несколько амфор.
Находка оказалась настолько серьезной, что отребовалось вмешательство властей.
В 1968 году начались работы по подъёму корабля. Когда работы по подъему были завершены, встал вопрос об очистке и сохранности пяти тонн дерева, на 75% состоявшего из воды и напоминавшего собой мокрую губку.
В одном из подсобных помещений керинийской крепости устроили нечто вроде бассейна, куда и поместили части корабля. Там их тщательно промывали и очищали от соли и песка. Детали судна, уже прошедшие стадию очистки, на специальных дисках поместили в пресную воду, где они дожидались химической обработки.
В течение двух лет специалисты самых различных отраслей науки, прилагая массу усилий, сделали пригодными для сборки еще совсем недавно деформированные шесть тысяч разрозненных деталей судна.
Сейчас этот древний корабль хранится в Керинийской крепости (на территории Турецкой Республики Северного Кипра).
А к началу проведения Олимпиады 2004 года специально была построена точная копия этого древнего торгового судна. Уникальный эксперимент мирового значения, связанный с изучением погрузки и укладки амфор и других грузов на древнее судно, был проведен в старом порту Лимассола. Вся работа была проделана согласно оригинальной программе, разработанной Культурным центром Кериния-Хрисокава в сотрудничестве и под наблюдением американских морских археологов Сьюзен Катцев и Лейны Совини. Точные копии 388 древних амфор и 29 мельничных жернов, изготовленных из вулканического камня, а также других предметов, которые перевозили древние корабли, были погружены на "Керинию-Элефтерию" — точную копию корабля, затонувшего у берегов Керинии и найденного четыре десятилетия назад.
В 2004 г. — в год вхождения Кипра в Евросоюз – «Кериния – Элефтерия» стала главным экспонатом морского музея в Айа-Напе.